Integradas en la Red Vasca de Ciencia, Tecnología e Innovación (RVCTI), las unidades de I+D empresarial, que conforman un entramado que supera los 70 centros tecnológicos, tienen como finalidad desarrollar proyectos competitivos de mejora de procesos y desarrollo de nuevos productos para las empresas o grupos empresariales a las que pertenecen. La creación de una Unidad de I+D Empresarial permite hacer más eficiente y especializada la organización de los recursos tanto humanos como económicos dedicados a la I+D. Asimismo, contribuye a la optimización fiscal de la empresa, aporta mayor capacidad de acceso a un mayor nivel de intensidad de subvención y, además, permite la solicitud de becarios dentro de los programas que gestiona la Fundación Iñaki Goenaga. Para saber si una Unidad de I+D es una solución adecuada para el desarrollo de una empresa es necesario realizar una valoración de las diferentes alternativas organizativas posibles para la gestión de la I+D en una empresa. En este sentido, el programa Aldatu, que promueve el desarrollo de replanteamientos estratégicos y organizativos, puede ser de ayuda para la elaboración de los estudios que sean necesarios.
Para articular la gestión de la Unidad de I+D Empresarial no existe ningún condicionante por lo que es una decisión de la empresa. Por lo general, la matriz presenta cuentas consolidadas y por lo tanto la decisión de cómo quiere realizar el gasto de la filial corresponde al departamento financiero del grupo y la optimización fiscal de la operación depende de diversas variables.