El ecosistema científico vasco cuenta con un nuevo abanderado de la transferencia tecnológica. Protellix se ha constituido como spin-off del centro de investigación CIC bioGUNE, centro de excelencia Severo Ochoa y miembro de BRTA, con el objetivo de transformar radicalmente la manera en que se conciben y optimizan las proteínas y enzimas para la industria y el sector farmacéutico. El lanzamiento de la compañía ha contado con el apoyo del programa Basque Tek Ventures, a través del Grupo SPRI.

La compañía nace como respuesta a una limitación histórica del sector biotecnológico: el desarrollo de proteínas ha estado condicionado por la exploración probabilística, lo que obliga a laboratorios y empresas a cribar miles de variantes mediante costosos procesos de ensayo y error. Protellix aleja la disciplina del azar y la orienta hacia un método racional, mediante un flujo de trabajo de ingeniería molecular predictiva estructurado en tres fases: Definir, modelar y validar.

Más allá de la inteligencia artificial: el rigor de la física molecular

Mientras muchas iniciativas se centran exclusivamente en modelos algorítmicos, la propuesta diferencial de Protellix se apoya en más de dos décadas de experiencia académica e industrial en química computacional y simulación molecular.

Su núcleo tecnológico actúa como un motor operativo que combina predicciones de aprendizaje profundo, simulación estructural y dinámica a escala atómica. En este marco, la inteligencia artificial no es un fin en sí misma, sino un acelerador que permite abordar restricciones estructurales complejas y anticipar cómo se comportarán las moléculas en condiciones reales de operación.

Un puente directo entre la simulación y el laboratorio

Uno de los principales rasgos diferenciales y activos estratégicos de Protellix es su vínculo directo con los laboratorios de vanguardia de CIC bioGUNE. La compañía valida de forma iterativa sus diseños in silico en las instalaciones del centro de investigación, un entorno de reconocido prestigio internacional con más de 200 científicos y plataformas de alta tecnología.

Este flujo de trabajo integrado permite responder a demandas críticas en sectores como el farmacéutico, la biocatálisis industrial, el foodtech y la biotecnología avanzada, y abarca áreas clave como las siguientes:
     • Ingeniería de enzimas para aplicaciones industriales, mediante la optimización de propiedades como la estabilidad térmica, la resistencia a disolventes, la actividad catalítica y la estabilidad en condiciones de operación exigentes.
     • Diseño y optimización de proteínas de interés biomédico, incluyendo proteínas terapéuticas, péptidos y anticuerpos de dominio único (VHH), con especial atención a propiedades como la estabilidad, la expresión y la solubilidad.
     • Diseño de nuevas proteínas de unión, mediante estrategias de diseño de novo orientadas al reconocimiento de dianas moleculares específicas.

Liderazgo científico y proyección de mercado

El equipo directivo de la compañía aúna investigación de vanguardia y experiencia comercial. Protellix ha sido fundada por Gonzalo Jiménez-Osés, profesor de investigación Ikerbasque y líder del laboratorio de química computacional en CIC bioGUNE, y Juan Pablo de Giacomi, emprendedor con experiencia en la creación y desarrollo de empresas biotecnológicas.

Gonzalo Jiménez-Osés, cofundador y director científico (CSO), cuenta con una trayectoria internacional en química computacional, simulación molecular e ingeniería de proteínas, con cerca de 200 publicaciones científicas. A lo largo de su carrera ha colaborado con investigadores de referencia internacional, entre ellos David Baker y Frances Arnold, galardonados con el Premio Nobel de Química por sus contribuciones al diseño computacional de proteínas y a la evolución dirigida de enzimas, respectivamente.

Juan Pablo de Giacomi, cofundador y consejero delegado (CEO), aporta más de ocho años de experiencia en el desarrollo de empresas de base científica. Entre sus iniciativas anteriores figura Innomy Biotech, compañía del sector foodtech de la que fue cofundador y CEO.

Una nueva iniciativa de transferencia tecnológica de CIC bioGUNE

La creación de Protellix se enmarca en la estrategia de CIC bioGUNE de promover la transferencia del conocimiento científico generado en sus laboratorios y favorecer su aplicación en el desarrollo de nuevas tecnologías, productos y servicios.

La compañía constituye un ejemplo de cómo la investigación en química computacional y biología molecular puede dar lugar a nuevas iniciativas empresariales, conectando capacidades científicas avanzadas con necesidades concretas del sector productivo.

“La creación de Protellix refleja nuestra apuesta por trasladar el conocimiento científico generado en CIC bioGUNE a aplicaciones concretas. Es un ejemplo de cómo la investigación de excelencia en química computacional y biología molecular puede impulsar nuevas iniciativas empresariales, conectando nuestras capacidades científicas con las necesidades de la industria”, señalan José Mª Mato y Jesús Jiménez-Barbero, director general y científico de CIC bioGUNE, respectivamente.

Con esta nueva spin-off, CIC bioGUNE continúa avanzando en su compromiso con la investigación de excelencia, la transferencia tecnológica y el desarrollo de un ecosistema biotecnológico capaz de generar conocimiento, innovación y actividad económica.