Enpresa Institutua–Instituto de Economía Aplicada a la Empresa lleva más de 35 años organizando másteres en Dirección y Gestión de Empresas y sus distintas áreas. Todos sus másteres, por tanto, tienen una dilatada experiencia y unos contrastados resultados, que les hacen ser de los másteres más exitosos de la UPV/EHU.
Los másteres de Enpresa Institutua, además de por su siempre actualizado contenido, se caracterizan por ser presenciales lo que es especialmente valorado por quienes los cursan. Asimismo, cuentan con la ventaja de estar cofinanciados por la Diputación Foral de Bizkaia e impartirse en la universidad pública lo cual hace que su precio, entre 5.000 y 6.000 euros, en función del máster, sea muy competitivo. El horario de varios de los másteres (viernes tarde y sábado mañana), les permite compatibilizarlos con la vida laboral por lo que, aunque son exigentes en dedicación, los cursan profesionales en activo deseando formarse e impulsar su carrera. Finalmente, en el caso de los posgrados que admiten a personas recién graduadas, el encaje profesional de sus egresados y egresadas es muy elevado para gran satisfacción de quienes lo cursan. 
Enpresa Institutua ofrece un Máster en Dirección y Gestión de Empresas Executive MBA, dirigido a profesionales con experiencia laboral, preferentemente directiva, interesados en mejorar sus conocimientos en gestión empresarial, impulsar sus habilidades directivas, y en hacer crecer su carrera y sus relaciones personales y profesionales. También ofrece un Executive Máster en Marketing y Dirección Comercial, con formación especializada en temáticas emergentes en marketing y ventas; un Máster en Emprendimiento y Dirección de Empresas, MBAe3, y un Máster en Mercados Financieros y Banca Privada (MFBP).